隨著1月8日起我國對新型冠狀病毒實施“乙類乙管”,國內(nèi)的新冠疫情防控進入了新階段,抗疫工作的重心也從“防感染”轉(zhuǎn)到“保健康、防重癥”。對于各級政府來講,穩(wěn)妥有序?qū)嵤耙翌愐夜堋笔且豁棌碗s的系統(tǒng)工程,面臨著新形勢和新任務。
在這一背景下,國家疾控部門進一步完善新冠病毒變異監(jiān)測的工作方案,確保人民群眾的健康安全,在本土案例監(jiān)測方面,每個省份都選擇了部分的城市和醫(yī)院作為監(jiān)測哨點,對門診病歷、重癥和死亡病例開展一定數(shù)量的新冠病毒感染病例的采樣和序列測定。
廣州醫(yī)科大學附屬市八醫(yī)院(以下簡稱廣州市八醫(yī)院)作為“入境患者定點收治醫(yī)院”,一直動態(tài)監(jiān)測新冠病毒變異的趨勢,以便能夠及時動態(tài)掌握人群感染發(fā)病水平和變化趨勢,科學研判和預測疫情規(guī)模、強度和流行時間,動態(tài)分析病毒株變異情況。
近日,廣州市八醫(yī)院基于華大智造的MGISEQ-2000基因測序儀、ATOPlex RNA多重PCR建庫試劑盒套裝V3.1以及metargetCOVID軟件的測序組合,在收治的境外輸入新冠病毒感染者中檢測出了BQ.1.25、XBB.1、XBB.2等奧密克戎亞型變異毒株。
測序報告顯示測出BQ.1.25、XBB.1及XBB.2等變異毒株
據(jù)悉,華大智造MGISEQ-2000是一款靈活高效的測序平臺,搭配2種通量的載片:大載片(FCL)和小載片(FCS),可獨立上機,單次運行數(shù)據(jù)產(chǎn)量可從55Gb到1,440Gb;ATOPlex RNA多重PCR建庫試劑盒套裝V3.1則采用328對混合引物(平均擴增178bp)來捕獲新冠病毒全基因組序列信息,對于低濃度、易降解的樣本友好、具有極高的靈敏度。再配合支持批量樣本快速分析MGI metargetCOVID軟件,可實現(xiàn)對新冠病毒的準確分型。
通過華大智造MGISEQ-2000、ATOPlexV3.1及metargetCOVID軟件的測序組合,廣州市八醫(yī)院能夠單次完成96*個新冠樣本的測序工作,得到病毒序列全長覆蓋率達到99%以上,測序效率高,測序結果質(zhì)量優(yōu)異。
事實上,早在2021年5月,華大智造就為廣州市八醫(yī)院提供新冠病毒測序工作提供工具支撐。僅在2021年5月21日至2021年6月18日不到1個月的時間里,該院就確診出159例新冠Delta毒株病例。依托華大智造的ATOPlex技術平臺和MGISEQ-2000測序儀的測序組合產(chǎn)品,廣州市八醫(yī)院聯(lián)合廣州醫(yī)科大學附屬第一醫(yī)院等單位成功實現(xiàn)對新冠Delta病毒全基因組的測序、比對、分型和溯源。
“華大智造提供的國產(chǎn)高通量測序工具組合準確、高效、操作簡便,為新冠病毒變異監(jiān)測提供了強大的技術支撐?!睆V州醫(yī)科大學附屬市八醫(yī)院傳染病研究所主任李鋒對于華大智造的測序工具組合表示了肯定。
作為國產(chǎn)測序儀龍頭,華大智造致力于成為“生命科技核心工具締造者”,其掌握的高通量測序技術在病原的監(jiān)測和溯源以及公共衛(wèi)生事件的應對中發(fā)揮著極其重要的作用。后續(xù)針對醫(yī)療機構、公共衛(wèi)生機構開展新型冠狀病毒感染疫情監(jiān)測的需求,華大智造實時、全景、全生命周期的測序產(chǎn)品組合,將持續(xù)助力病毒變異監(jiān)測工作,為新階段下的防控工作貢獻一份力量。


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