PMseq Datician病原專家分析系統(tǒng)是華大基因（300676）自主開發(fā)的智能集成化本地生信分析服務(wù)器，可與PMseq 病原高通量測序?qū)嶒炦^程自動偶聯(lián)，一鍵智能生成檢測報告，無需專業(yè)的生信分析人員，保證了數(shù)據(jù)安全和結(jié)果準(zhǔn)確。

基于PMseq Datician病原專家分析系統(tǒng)的PM Display、PM Online組件，可輕松實現(xiàn)線上數(shù)據(jù)管理分析、報告智能生成功能，讓PMseq 組學(xué)大數(shù)據(jù)分析簡單易用！

PM Display智能報告系統(tǒng)

PM Display智能報告系統(tǒng)是配套PMseq 病原微生物高通量測序產(chǎn)品的組學(xué)大數(shù)據(jù)分析系統(tǒng)，實現(xiàn)對PMseq 病原檢測后的檢測結(jié)果歸集、存儲、統(tǒng)計、分析、數(shù)據(jù)挖掘。使用可視化操作界面，人工確定檢出病原為最終臨床報告。該系統(tǒng)帶自我學(xué)習(xí)功能，在使用過程中不斷結(jié)合用戶給出的結(jié)果優(yōu)化默認(rèn)推薦病原，并能結(jié)合PM Online給出不同病原的檢出分布。

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PM Online線上數(shù)據(jù)管理系統(tǒng)

PM Online線上數(shù)據(jù)管理系統(tǒng)集成了PMseq 自動化病原分析數(shù)據(jù)平臺，使得病原鑒定組學(xué)數(shù)據(jù)在中心本地化集中存儲，實現(xiàn)用戶在線授權(quán)訪問，可以協(xié)助醫(yī)院實現(xiàn)病原組學(xué)檢測數(shù)據(jù)管理、病原統(tǒng)計、檢出頻率、病原譜和時空分布等統(tǒng)計分析功能；并且支持?jǐn)?shù)據(jù)共享合作，臨床和基因組學(xué)科學(xué)研究，可為醫(yī)院及疾控等機構(gòu)的大數(shù)據(jù)分析與再挖掘提供強有力的技術(shù)平臺支撐。

升級亮點

數(shù)據(jù)定時交互

PM Display與PM Online進(jìn)行數(shù)據(jù)定時交互，實現(xiàn)報告解讀到數(shù)據(jù)收集統(tǒng)計的一體化和自動化。

更完善！更全面！更科學(xué)！

PMseq 報告配置不斷更新升級，使其更完善！更全面！更科學(xué)！配置PMseq 默認(rèn)報告模板以及個性化報告模板；上線“檢出疑似耐藥基因列表”和“檢出疑似毒力基因列表”；升級“參考文獻(xiàn)”和“微生物說明”數(shù)據(jù)庫！

報告節(jié)選

數(shù)據(jù)更豐富

新增“樣本類型特異性的病原微生物檢出率”，輔助解讀人員對出列微生物更好地判讀。

助力城市Q熱疫情流行監(jiān)控

2021年7月，中山大學(xué)附屬第五醫(yī)院聯(lián)合華大基因研究團(tuán)隊，在國際期刊《PLoS Negl Trop Dis》(IF=4.4) 上發(fā)表一篇科學(xué)論文，闡述了2018年底至2019年初，研究者利用宏基因組測序技術(shù) (mNGS) 在珠海監(jiān)控到了城市Q熱疫情流行[1]。

研究者對疑似感染的未知病原發(fā)熱查因患者進(jìn)行PMseq 檢測，監(jiān)測到中大五院2018年4月份開始檢測到貝納特柯克斯體，確診Q熱病例，并在接下來的十幾個月中持續(xù)檢測到該病原體，且在2018年底和2019年初達(dá)到了檢出率的高峰。

研究者在該病原體檢出最高峰時期采集了珠海市唯一屠宰場的牛、羊血液，同樣用PMseq 檢測到了較高比例的貝納特柯克斯體陽性樣本。然后，研究者利用該批病人的手機定位數(shù)據(jù)，結(jié)合牛、羊樣本檢測結(jié)果，推測了一起可能由動物傳染、聚集傳播的城市Q熱流行事件[1]。

病原體mNGS檢測已經(jīng)全新開啟醫(yī)院本地化建設(shè)的新篇章。基于PMseq Datician病原專家分析系統(tǒng)的PM Display、PM Online組件升級，助力數(shù)據(jù)管理及報告解讀更智能，讓病原宏基因組測序數(shù)據(jù)簡單易用！華大基因?qū)⒉恍概μ嵘a(chǎn)品質(zhì)量，為臨床精準(zhǔn)診療提供更全面的解決方案，讓更多百姓受益于基因科技。